Le laboratoire SeqOIA (Sequencing, Omics, Information Analysis) est l’un des deux laboratoires de biologie médicale sélectionné par le Ministère des Solidarités et de la Santé dans le cadre du Plan France Médecine Génomique 2025.Le support juridique du laboratoire est un Groupement de Coopération Sanitaire (GCS SeqOIA) de droit privé associant l’AP-HP, l’Institut Curie et Gustave Roussy.

Le laboratoire SeqOIA comprend deux sites qui sont des plateaux techniques non accessibles au public :

  • SeqOIA-GEN (site Broussais): réception et enregistrement des prélèvements, extraction, quantification, qualification des acides nucléiques, préparation des librairies, séquençage.
  • SeqOIA-IT (site Picpus): site depuis lequel sont opérés développement et maintenance des chaines de traitement bioinformatique, développement et maintenance des solutions logicielles (Sonar, SPICE, gGleaves), stockage-archivage des données et structuration des données, sur les serveurs hébergés par les centres de données de l’AP-HP.

Les examens proposés par le laboratoire sont les suivants :

  • Génétique constitutionnelle (maladies rares, oncogénétique) : séquençage de génome.
  • Génétique somatique (cancers) : analyse tumorale comprenant exome + génome + transcriptome tumoral et génome constitutionnel.

Les prescriptions sont issues de la zone SeqOIA : régions Ile-de-France, Bretagne, Pays de la Loire, Normandie, Hauts de France, Centre Val de Loire.


Les pré-indications sont au nombre de 67 en maladies rares, 4 en oncogénétique et 11 en cancer.
Les examens sont interprétés et validés à distance par près de 250 biologistes repartis dans la zone SeqOIA.

En prévision de la montée en charge continue et des évolutions anticipables du PFMG V2, le laboratoire SeqOIA doit consolider son effectif de biologistes couvrant les préindications les plus pourvoyeuses d’examens : TND-DI±TSA, malformations (~75% des examens).

 

L’offre concerne un poste de Biologiste de site SeqOIA.
Le poste est affecté à SeqOIA-GEN (site Broussais) : bâtiment Ady Steg, RDC bas, rue Huguette Schwartz, 75014 PARIS.
Conformément à l’Article L6222-6 du CSP : Sur chacun des sites, un biologiste du laboratoire doit être en mesure de répondre aux besoins du site et, le cas échéant, d’intervenir dans des délais compatibles avec les impératifs de sécurité des patients. Pour assurer le respect de cette obligation, le laboratoire doit comporter un nombre de biologistes au moins égal au nombre de sites qu’il a créés. Le biologiste assumant la responsabilité du site doit être identifiable à tout moment.
Les biologistes de site SeqOIA sont dédiés au respect de cette exigence : ils participent par roulement à la continuité de service permettant de répondre aux besoins des deux sites du laboratoire. Un planification de disponibilité est donc mise place. La disponibilité du biologiste de site est effective sur site ou à distance.

  • Diplôme de biologie médicale ou autorisation d’exercice de la biologie médicale dans le domaine restreint de la génétique (par exemple : médecin titulaire d’un DES de génétique médicale avec autorisation d’exercice de la biologie médicale).
  • Agrément ABM pour la réalisation des ECGPFM.
  • Habilitation préalable en qualité de Biologiste SeqOIA génétique constitutionnelle (GC) ou somatique (GS).
  • Qualités professionnelles : rigueur, capacité d’adaptation et esprit d’équipe. 

 

  • Validation biologique des examens
  • Réponse aux besoins des CPG SeqOIA (demande de priorisation, d’extension et de réanalyse notamment)
  • Réponse aux besoins techniques (site Broussais) et bioinformatiques (site Picpus)
  • Participations aux réunions techniques (Site Broussais et groupe bioinfo)
  • Encadrement des internes affectés à SeqOIA
  • Participation à la validation des méthodes
  • Suppléance du biologiste-responsable du laboratoire, le cas échéant.
  • Directeur du laboratoire (biologiste-responsable du laboratoire) : n+1
  • Biologiste-responsable du laboratoire et autres biologistes de site
  • Ensemble du personnel médical et non médical
  • Directrice opérationnelle du GCS
  • Adjointe à la directrice opérationnelle du GCS

 

  • Poste à 100%.
  • Télétravail possible, pour une quotité à évaluer en fonction du profil de chaque candidat.
  • Plages horaires du laboratoire : lundi au vendredi de 8h à 18h30
  • Une présence chaque jour de biologiste de site au laboratoire est à organiser. 
  • Les congés doivent être planifiés en lien avec les autres bologistes de site afin d’organiser la permanence de la prise en charge. 
  • Embauche en qualité de PHC ou PH, en fonction du profil du candidat. Recrutement par l’un des établissements du GCS et mise à disposition (MAD) du laboratoire SeqOIA, ou mise à disposition possible depuis l’établissement d’affectation du praticien.

Pierre Blanc, directeur du laboratoire SeqOIA : pierre.blanc@aphp.fr
Lara Vinauger, directrice opérationnelle du GCS : lara.vinauger@aphp.fr